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    真核有參/無參轉(zhuǎn)錄組

    • 產(chǎn)品簡介
    • 技術(shù)流程
    • 樣本要求
    • FAQ

    轉(zhuǎn)錄組測序可以通過高通量測序平臺針對真核生物特定組織或細(xì)胞在某個特定狀態(tài)下轉(zhuǎn)錄的所有mRNA進(jìn)行測序，快速檢測基因表達(dá)量、序列結(jié)構(gòu)及功能注釋信息，了解不同表型下基因表達(dá)的差異轉(zhuǎn)態(tài)。目前已經(jīng)廣泛應(yīng)用于動植物發(fā)育調(diào)控、脅迫研究、遺傳進(jìn)化研究等方向。

    產(chǎn)品優(yōu)勢
    • 經(jīng)驗(yàn)豐富
      提取成功率85%+，建庫成功率95%+，物種經(jīng)驗(yàn)100+，項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)10000+
    • 快速周期
      自動化操作體系，保證數(shù)據(jù)結(jié)果的同時，實(shí)現(xiàn)快速交付
    • 組學(xué)分析
      支持以轉(zhuǎn)錄組為核心，聯(lián)合表觀，基因組、單細(xì)胞產(chǎn)品等多種分析策略
    • 一站式服務(wù)
      售前方案設(shè)計，售中異常解決，售后個性化分析，多方位服務(wù)
    產(chǎn)品特點(diǎn)
    • 應(yīng)用廣泛
      真核生物有參無參均可分析，覆蓋生物學(xué)、農(nóng)學(xué)等領(lǐng)域
    • 短平快
      技術(shù)成熟、周期快速、質(zhì)量可靠
    • 組學(xué)橋梁
      是連接基因組遺傳信息與生物功能的蛋白質(zhì)組的紐帶，可以與上下游多種組學(xué)聯(lián)合分析
    • 分析豐富
      除基因表達(dá)及結(jié)構(gòu)分析外，對于檢測低豐度轉(zhuǎn)錄本和發(fā)現(xiàn)新轉(zhuǎn)錄本具有其獨(dú)特的優(yōu)勢
    產(chǎn)品類型測序平臺及策略推薦數(shù)據(jù)量周期
    真核轉(zhuǎn)錄組測序

    二代測序 PE150

    		有參：6/8/10 G clean data14天
    無參：6/8/10 G clean data24天

    產(chǎn)品類型樣品要求
    真核轉(zhuǎn)錄組樣品需求量

    ≥0.3 μg

    樣品濃度

    ≥30 ng/μl

    樣品純度
    		OD260/280=1.8~2.2，OD260/230 除特別異常（負(fù)值 、超 2.5），不納入判定
    RNA完整性

    RIN≥4

               
    • Q：做轉(zhuǎn)錄組測序一般需要測多大數(shù)據(jù)量？
      A：
      轉(zhuǎn)錄組測序所需的測序量隨研究目的的不同而有所差異。目前，為保證數(shù)據(jù)分析結(jié)果的可靠性和準(zhǔn)確性，推薦對有參考基因組的轉(zhuǎn)錄組采用最低6 Gb clean data進(jìn)行后續(xù)分析，如果想檢測到低豐度的轉(zhuǎn)錄本推薦采用10 Gb clean data。如果沒有參考基因組，需要進(jìn)行轉(zhuǎn)錄本的拼接組裝，為了拼接組裝的完整性，推薦10 Gb clean data的轉(zhuǎn)錄組測序。

    • Q：轉(zhuǎn)錄組測序的技術(shù)重復(fù)性很高，那是否還有必要設(shè)生物學(xué)重復(fù)？
      A：
      目前我們推薦至少設(shè)置3個及以上生物學(xué)重復(fù)，5個以上的生物學(xué)重復(fù)更好。在樣本分析過程中，常會出現(xiàn)某個樣本離群導(dǎo)致生物學(xué)重復(fù)不足3個的情況，為了避免后期投稿過程中受到審稿人的質(zhì)疑，我們建議盡可能的多設(shè)置生物學(xué)重復(fù)，增加差異基因的檢出率，減小整體假陽性率。

    • Q：無參轉(zhuǎn)錄組拼接注釋后，能得到的注釋基因有多少？
      A：
      注釋基因的多少跟所研究的物種直接相關(guān)，如某些比較重要的物種基因研究的比較多，功能也比較清楚，注釋得到的基因就會很多，反之則會比較少。
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